教授　　遠藤 俊徳    准教授　長田 直樹

目標

配列決定技術の発展に伴い、多くの生物のゲノム配列が解読・公開されるようになった。 膨大なデータが次々に生み出され、そろそろ「生命とはなにか」の答えが出てきても良さそうだ。 しかし、多細胞生物では遺伝子数すら解明されたものは皆無である。 それどころか「粒子としての遺伝子」の概念を「遺伝子機能情報を含むDNA領域」に 当てはめることが難しくなり、「遺伝子」の概念さえ議論の対象となった。 バイオインフォマティクスは、生命に関わる分子の構造・状態の情報を用い、 既存知識や様々な尺度・手法に基づく類似度を規準に、 「遺伝子」や「タンパク質」の機能と振舞いの分類・予測方法開発と応用を扱ってきた。 一方で、配列や物理的構造の情報は観測可能な基盤であり、 遺伝子の定義が曖昧になったいま、既存知識への依存度の低い解析方法や 考え方がますます求められている。 我々は、こうした問題に取り組む研究の推進を目指している。

各種情報

• 学生・ポスドクを随時募集しています。

• バイオインフォマティクス、分子進化学研究、タンパク質立体構造・相互作用、遺伝子情報解析に関心のある方はご連絡ください。
• 遺伝学用語編纂サイト
• 大学院 ・大学入試情報
  • 修士課程受験者はTOEFLかTOEICのスコアシート提出が必要になりました。
  • 結果送付日に注意:ギリギリだと出願に間に合いません
• 留学希望者へ （北大の留学案内 文部科学省「国費外国人留学制度について」）

• 修士論文・卒業論文作成のタイムライン を確認しながら計画的に研究を進めてください。
• 研究の進め方に迷ったら、Google(特殊検索)、Google Scholar、NCBI Pubmedで検索し、関連論文に目を通してください。漠然と相談に来られてもお互いに困るだけです。iBio
• RA, TA, 国際・国内学会参加、学生支援プログラム (CEED)、企業インターンシップ、英語学習などの、各種の学習・経済支援が充実しています。制度を上手に活用してください。
• 簡単なコマンドラインの入力記録方法

• 就職活動を最優先として認めることはありません。節度をもって行ってください。
• 安田先生の集団遺伝学オンライン講義、お勧めです。
• Wikipediaの利用について
• Wikipediaは広範囲の知識をカバーする新しいタイプの百科事典ですが，不正確な記事も散見されます。英語版と日本語版で内容の詳しさ・正確さが大幅に違うことも多々あります。利用の際は、引用文献や印刷された教科書や辞書との比較確認が必要です．
• 卒業生へ
• • 卒業生向けの大学メールアドレスが取得できます。
  • 卒業生のibio.jpのアカウントは当面は卒後も使える予定です。
    
    
• 学会等
• 学会発表は修了要件の一つです。
• 演題登録締切のひと月前までに要旨原稿を作成し、研究ノートおよび研究まとめを持参して相談してください。
• 主要学会： SMBE (6月頃 〆2月) 日本遺伝学会(9月頃〆7月) 日本バイオインフォマティクス学会（10月頃〆7月）日本分子生物学会(11月頃〆8月) 
• バイオインフォマティクス技術者認定試験について

連絡先 †

〒060-0814 札幌市北区北14条西9丁目
北海道大学 大学院情報科学研究科 情報生物学研究室
(情報科学研究科棟 9-25室)

地下鉄北１２条駅から徒歩約15分、JR札幌駅から徒歩約30分（タクシー10分）です。
 詳細は右図、交通アクセスをご参照ください。

学内バス乗り場・時刻表

電話番号 (外線からは011-706-番号)
教授室 (6547)、准教授室9-24 (7332), 9-07 (7334), 9-08 (7392) 9-09 (6933)

研究室内用 †

GMail backup

• MATLABが使用可能です。必要な情報はサイボウズの掲示板に置いてあるので各自で確認してください。
• 統計処理にはR、Octave (日本語解説)、MATLABを使用すると良いでしょう。

• セキュリティについて
  • ファイル交換ソフト(P2P)使用は厳禁です。過失でも処罰対象になるので注意してください。
  • 研究室内の個人用PCはファイアウォールの内側に設置されていますが、ダウンロードおよびUSBメモリやCD-ROM等を介したファイルのやりとりの際はウイルスチェックをしてください。
  • トレンドマイクロのウイルスバスターライセンスを人数分確保しています。ウイルス対策にClamWinなどを使用している場合を除き、確実にインストールし、定期的にスキャンしてください。
• カレンダーに予定を記入してください。

研究テーマ案 PukiWikiヘルプ 旧HP

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